第二代高通量测序技术用于进口细菌型微生物肥料菌群分析

Next Generation Sequencing Technique for the Analysis of the Bacterial Community Structure about Bacterial Microbial Fertilizers

doi:
10.3969/j.issn.0517-6611.2017.28.049
摘要:
[目的]分析细菌型微生物肥料菌群结构.[方法]采用第二代高通量测序技术对细菌型微生物肥料菌群结构进行分析.[结果]产品中测序出的111个OUT具体分属于24个属的细菌,其中共有21个OUT鉴定到种;植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)和短乳杆菌(Lactobacillus brevis)占菌群的主要位置,分别是96.29%和0.66%,其他菌占3.05%;该样品中含有假单胞菌属(Pseudomonas sp.),这提示样品中可能含有植物病原细菌.[结论]将第二代高通量测序技术用于微生物肥料菌群分析,为进出口微生物肥料产品的快速分析提供了一种方法.
Abstract:
[Objective]To study the bacterial community structure of import microbial fertilizers.[Method]Next generation sequencing technique was used to analyze the bacterial community structure of import microbial fertilizers.[ Result] 111 OUTs were identified as 24 genus.Lactobacil-lus plantarum and Lactobacillus brevis accounted for 96.29% and 0.66%, and the other bacteria accounted for 3.05%.Pseudomonas sp.has been found which means plant pathogenic bacteria may contain in this product.[Conclusion]Next generation sequencing technique has been de-veloped for analyzing the bacterial community structure of microbial fertilizers, which can be used for the import or export of microbial fertilizers.
作者 刘玉莉[1]    魏霜[2]    刘碧琳[1]    鄞杰平[1]    林利平[1]
Author:
作者单位
  1. 汕头出入境检验检疫局,广东汕头,515041
  2. 广东出入境检验检疫局检验检疫技术中心,广东广州,510000
刊 名: 安徽农业科学   ISTICPKU
Journal: Journal of Anhui Agricultural Sciences
年,卷(期) 2017, 45(28)
分类号 S144
关键词: 第二代高通量测序 知识脉络    微生物肥料 知识脉络    菌群 知识脉络   
Keywords: Next generation sequencing technique    Microbial fertilizers    Bacterial community   
机标分类号
基金项目 国家质量监督检验检疫总局科技计划项目
参考文献和引证文献
参考文献
引证文献
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